중도 퇴사자 연말정산 — 퇴직한 월 급여에서 정산 · 원천징수영수증 · 5월 신고

1. 퇴직한 날이 속하는 월의 급여를 지급할 때 정산합니다

원천징수의무자는 퇴직자가 퇴직하는 월의 근로소득을 지급할 때 연말정산 방식으로 소득세를 원천징수합니다(소득세법 제134조 제2항 제2호 · 제137조 제1항). 이때 정산하는 과세기간은 1월 1일부터 퇴직하는 날까지이며(제137조 제1항 제1호), 계산 방법은 계속 근로자의 연말정산과 같은 조문을 따릅니다. 원천징수한 세액과 세액공제의 합계가 산출세액보다 많으면 그 초과액을 환급합니다(같은 조 제2항).

국세청은 2023년 8월 25일부터 중도퇴사자의 지급명세서를 홈택스로 상시 제출할 수 있다고 안내합니다. 계속 근로자의 2월 연말정산 일정은 연말정산 회사 일정에 정리했습니다.

2. 공제신고서와 공제 범위

근로자가 종합소득공제와 세액공제를 적용받으려면 퇴직한 날이 속하는 월의 근로소득을 받기 전에 근로소득자 소득 · 세액 공제신고서를 원천징수의무자에게 제출합니다(소득세법 제140조 제1항, 같은 법 시행령 제198조 제1항). 제출하지 않으면 기본공제 중 근로자 본인분과 표준세액공제만 적용해 정산합니다(제137조 제3항).

국세청은 과세기간 중에 중도 취업하거나 중도 퇴사한 사람은 근로제공기간 동안 지출한 비용에 한하여 특별세액공제를 받으며, 기부금은 제외라고 안내합니다.

3. 퇴사 처리 순서

4. 같은 해에 재취업하면

중도에 퇴직하고 새 근무지에 취직한 근로자가 종전 근무지에서 1월부터 퇴직한 날이 속하는 월까지 받은 근로소득을 포함해 공제신고서를 제출하면, 새 근무지의 원천징수의무자는 두 근로소득을 더한 금액으로 연말정산합니다(소득세법 제138조 제1항). 이때 새 근무지는 전 근무지의 근로소득 원천징수영수증과 근로소득원천징수부 사본을 제출받습니다(같은 법 시행령 제197조 제1항).

2명 이상으로부터 근로소득을 받은 사람은 이렇게 합산해 연말정산하여 확정신고로 납부할 세액이 없는 경우가 아니면, 다음 해 5월 종합소득 과세표준 확정신고 예외가 적용되지 않습니다(제73조 제2항).

5. 근로자의 5월 종합소득세 신고

근로소득만 있는 사람은 과세표준확정신고를 하지 않을 수 있습니다(소득세법 제73조 제1항 제1호). 다만 원천징수의무자가 연말정산(제137조 · 제138조 등)으로 소득세를 원천징수하지 않았으면 이 예외가 적용되지 않습니다(같은 조 제4항). 확정신고 기간은 다음 연도 5월 1일부터 5월 31일까지입니다(제70조 제1항).

6. 지방소득세와 건강보험료 퇴직 정산

근로소득세를 원천징수할 때 그 소득세의 10%를 지방소득세로 함께 특별징수합니다(지방세법 제103조의13 제1항). 건강보험료도 퇴직할 때 정산합니다. 사용자는 사용관계가 끝나면 해당 직장가입자가 납부한 보수월액보험료를 다시 산정해 근로자와 정산한 후 공단과 정산 절차를 거칩니다(국민건강보험법 시행령 제39조 제2항). 자세한 내용은 건강보험료 연말정산에 정리했습니다.

근거 : 소득세법 제70조 제1항 · 제73조 제1항 · 제2항 · 제4항 · 제128조 · 제134조 제2항 · 제137조 · 제138조 · 제140조 제1항 · 제143조 제1항 · 제164조 제1항, 같은 법 시행령 제197조 · 제198조, 지방세법 제103조의13, 국민건강보험법 시행령 제39조 제2항, 국세청 「세액계산방법」 · 「특별세액공제」 · 「종합소득세 신고」 · 「연말정산 종합 안내」 안내, 국세상담센터 2024년 귀속 안내. 2026년 10월 기준이며, 개별 사안은 국세청 상담센터(126) 확인을 권합니다.